Konformasyonel Dinamik Yönlendirmeli Farmakofor Modelleme ile Güçlü Antikanser Ajanlarının Belirlenmesi
نویسندگان
چکیده
Targeting the interaction between tumor suppressor p53 and murine double minute 2(MDM2) has been an attractive therapeutic strategy of recent cancer research. There are a few number MDM2-targeted anticancer drug molecules undergoing clinical trials, yet none them have approved so far. In this study, new approach is employed in which dynamics MDM2 obtained by elastic network models used as guide generation ligand-based pharmacophore model prior to virtual screening. Hit exhibiting high affinity were captured tested rigid induced-fit molecular docking. The knowledge binding mechanism was while creating docking criteria. Application Molecular Mechanics-Generalized Born Surface Area (MM-GBSA) method provided accurate prediction free energy values. Two leading hit shown better scores, values drug-like properties identified. These hits exhibited extra intermolecular interactions with MDM2, indicating stable complex formation hence would be further vitro. Finally, combined computational study can promising tool design for discovery potential hits.
منابع مشابه
Statik ve Dinamik Analizler ile Hesaplanan Risklere Dayalı Olarak Test Modellerinin İyileştirilmesi
Özet. Model bazlı test teknikleri, sistem kullanım modelinden test senaryolarının otomatik olarak oluşturulmasını sağlayarak verimliliği artırmaktadır. Prensip olarak sonsuz sayıda test senaryosu oluşturmak mümkündür; ancak bu senaryoları sınamak için kaynaklar kısıtlıdır. Dolayısıyla, kullanılan modelin içeriği ve test senaryosu oluşturma teknikleri, etkin bir şekilde hataların tespit edilmesi...
متن کاملBütünleşik İş Süreçleri Modelleme Yaklaşımı ile Nitelikli Şartname Oluşturma: Bir Durum Çalışması
متن کامل
Plural Yöntemi ile BPMN Tabanlı Özne Yönelimli Süreç Modelleme: Örnek Olay İncelemesi
Özet. Özne yönelimli süreç modelleme yaklaşımı daha doğru, kesin ve aslına uygun süreç bilgisine ulaşmak amacıyla süreç öznelerine (rol, aktör, vb.) ve bunlar arasındaki etkileşime odaklanır. Yaygın çerçevede, iş süreçleri çoğu zaman yukarıdan-aşağıya yaklaşımını kullanan süreç mühendisleri veya modelleme uzmanları tarafından modellenirler. Ancak bu yaklaşım, özellikle bilgi-odaklı çalışan kuru...
متن کاملBazı evcil hayvanlarda albuminin elektroforetik ve boya bağlanma yöntemleri ile karşılaştırmalı tayini ve spesifitelerinin belirlenmesi
Özet: Günümüzde albumin tayininde genellikle bromocreosol purple (BCP) ve bromocreosol green (BCG) gibi fitalein boyalar kullanılmaktadır. Ancak bu yöntemlerde albuminin boya bağlanma affinitesi türlere göre farklılıklar göstermekte, preanalitik ve analitik faktörler de sonuçlar üzerinde etkili olmaktadır. Bu çalışmada domuz, sığır ve koyunda albumin düzeylerinin BCP ve BCG boya bağlanma yöntem...
متن کاملUML ile Modellenen Coğrafi Verilerin XSLT Yardımıyla OWL'a Dönüştürülmesi
Özet. Coğrafi Bilgi Sistemleri (CBS), disiplinler arası sorunları çözme amaçlı geliştirilmiş, coğrafi ve sözel veri tabanına sahip, güçlü donanıma ihtiyaç duyan bir yazılım teknolojisidir. CBS, günümüz ihtiyaçları doğrultusunda Anlamsal Web’e doğru yönelmektedir. Anlamsal Web’in gerçekleştirilmesini savunduğu, bilgi sistemler arası veri paylaşımı ve birlikte çalışılabilirlik, mevcut UML (Unifie...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi
سال: 2023
ISSN: ['1308-6529', '1300-7688']
DOI: https://doi.org/10.19113/sdufenbed.1121167